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Structure et dynamique aux échelles de temps ultra-rapides
Eric Collet, lauréat du prix Alajos Kálmán 2022 distinguée par l'European Crystallography Association, nous livre un aperçue de ses récents résultats basés sur les techniques ultrarapides et la photocristallographie.
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Le 11ème prix Bertaut attribué au Dr Lukáš Gajdos
Lukáš Gajdos obtained his PhD degree in Structural biology at the University Grenoble Alpes and the Institut Laue-Langevin in Grenoble under the supervision of Dr. Anne Imberty from the Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV, CNRS). The main topic of his research was structural studies of lectins that are involved in bacterial infection using neutron macromolecular crystallography (NMX).
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L’ordre est le plaisir de la raison, mais le désordre est le délice de l’imagination (08-2020)
Paul Claudel écrivait cette phrase en 1929 dans son ouvrage "Le soulier de satin". Tel aurait pu être le titre du nouvel article paru en 2020 dans la revue "Physical Review B", de l'équipe rennaise de cristallographie physique de Bertrand Toudic, article consacré à l'étude de mise(s) en ordre multiples dans un MOF et intitulé "Symmetry breakings in a metal organic framework with a confined guest". Dans cet article, ils lèvent le voile sur une série de transitions de phases particulièrement complexes qui impliquent tour à tour une mise en ordre des spins des atomes de fer constituant le MOF [Fe(tvp)2(NCS)2], puis une mise en ordre des ligands et finalement une mise en ordre des molécules de benzaldéhyde insérées au sein du MOF.
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Une PET dépolymérase pour le recyclage des bouteilles en plastique à l’infini (04-2020)
Dans un article paru en 2018 sur le site de l'Association Française de Cristallographie, Samuel Tranier et Jean-Denis Pedelacq rapportent comment la caractérisation par rayons-X d'une enzyme mangeuse de PET aide à comprendre le mécanisme de la dépolymérisation enzymatique du polytéréphtalate d’éthylène (PET). Ils écrivent à la fin de leur article que tout reste à optimiser avant de pouvoir envisager une application industrielle. Depuis les travaux n'ont pas cessé: dans un article paru dans Nature (Avril 2020), des chercheurs toulousains et auvergnats décrivent une étape importante pour une application industrielle et comment la biologie structurale a été décisive pour guider les modifications à apporter pour améliorer les performances de l’enzyme.
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La dépolymérisation enzymatique des plastiques : un début de réponse à un problème environnemental majeur (07-2018)
Le polyéthylène téréphtalate (PET) est un des polymères synthétiques les plus couramment utilisés après le polyéthylène et le polypropylène, dans les emballages et les produits textiles. La dégradation naturelle du PET pouvant prendre plusieurs siècles, son accumulation devient donc un enjeu environnemental majeur qui risque de perdurer, à moins que des solutions innovantes ne soient identifiées. Samuel Tranier et Jean-Denis Pedelacq de l'Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale à Toulouse commentent un article paru récemment dans PNAS décrivant la caractérisation par rayons-X d'une enzyme mangeuse de PET. -
Prix Nobel de Chimie 2017 (12-2017)
Cette année, le Prix Nobel de Chimie 2017 a été décerné à Jacques Dubochet (Suisse), Joachim Frank (Etats-Unis) et Richard Henderson (Grande-Bretagne) pour « avoir développé la cryo-microscopie électronique afin de déterminer la structure haute résolution des biomolécules en solution ». C'est une récompense qui vient couronner l'extraordinaire effervescence qu'il y a eu ces dernières années autour de la cryo-microscopie. -
Structure d’une histidine kinase sensorielle : le nitrate ouvre la charnière (11-2017)
C'est bien connu, les bactéries font preuve d'une grande capacité d'adaptation. Adapter son comportement en fonction de son environnement est crucial pour tous les organismes : les bactéries traitent l'information chimique ou physique pour y répondre. Dans un article publié récemment dans la revue Science, un consortium international, dont des chercheurs à l'Institut de Biologie Structurale à Grenoble, présente un système d'adaptation via un simple ligand nitrate. -
Les lasers à électrons libres émettant des rayons X : nouvelles opportunités scientifiques pour la cristallographie ! (10-2017)
L'European XFEL, inauguré le premier septembre 2017 à Hambourg, accueille actuellement ses premiers utilisateurs. Cette nouvelle source européenne de rayons X est un laser à électrons libres émettant des flashs de rayons X ultra-intenses et ultracourts (XFEL pour l'expression anglaise de X-ray Free Electron Laser) : une seule impulsion comporte de l'ordre de 1012 photons, ce qui correspond au nombre de photons émis par seconde sur une ligne de lumière d'une source de rayonnement synchrotron. -
Mais où sont les hydrogènes : la réponse des électrons ! (01-2017)
La diffraction des électrons a le vent en poupe ! Dans un précédent commentaire paru en septembre 2015 sur le site de l'Association Française de Cristallographie, il est décrit comment il est désormais possible d'affiner de façon dynamique des modèles structuraux en utilisant des données de diffraction des électrons enregistrées en mode tomographique. L'équipe de cristallographes de l'Institut de Physique à Prague s'est associée aux chercheurs du CRISMAT (Laboratoire de Cristallographie et Sciences des Matériaux) et du LCS (Laboratoire Catalyse et Spectrochimie) à Caen pour une application très précise de ces méthodes : la localisation des hydrogènes dans des micro-cristaux. Les résultats sont décrits dans le journal Science du 13 janvier 2017. Pascal Roussel (Laboratoire UCCSà Lille) explique. -
Lorsque compter les électrons permet une analyse quantitative en DRX de poudres (01-2017)
En clotûre du centenaire de la diffraction de poudres C. Kouvatas, T. Bataille (ISCR, Rennes) et F. Goutenoire (IMMM, Le Mans) commentent un nouveau développement dans le domaine de l'analyse quantitative de phases cristallines, probablement l'application la plus importante de la diffraction de poudres (H. Toraya: « A new method for quantitative phase analysis using X-ray powder diffraction: direct derivation of weight fractions from observed integrated intensities and chemical compositions of individual phases » - J. Appl. Cryst., 2016, 49, 1508-1516).
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Les MOFs comme vecteurs pour la détermination de la configuration absolue de petites molécules (10-2016)
La détermination de la configuration absolue d'une molécule chirale et celle de la structure absolue d'un cristal non-centrosymétrique par diffraction de rayons X reste depuis la proposition en 1983 du paramètre de Flack l'objet de nombreuses recherches en cristallographie. Dans un article récemment paru dans Science (Coordinative alignment of molecules in chiral metal-organic frameworks; Lee, Kapustin & Yaghi, Science 353, 808-811 (2016)) une nouvelle méthode est proposée pour déterminer la configuration absolue de petites molécules en utilisant des MOFs chiraux. Jean-Claude Daran (LCC, Toulouse) et Michel Giorgi (Spectropole, Marseille) donnent leur point de vue. -
Au-delà des taches de Bragg (07-2016)
L'un des évènements phares du colloque de l'AFC édition 2016 à Marseille a été la Table Ronde « Grands Instruments : nouvelles perspectives ». Martin Weik et Jaques-Philippe Colletier (Institut de Biologie Structurale à Grenoble) commentent ici une de ces nouvelles perspectives : Imagerie macromoléculaire de cristaux imparfaits par rayonnement XFEL.
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Combiner réflectivité X spéculaire et fluorescence en X rasants .. (02-2016)
La session 4 du colloque 2016 de l'Association Française de Cristallographie était dédiée au couplage de la diffusion, la diffraction et la spectroscopie. Daniel Chateigner (Laboratoire de Cristallographie et Sciences des Matériaux à Caen) analyse quelques développements récents dans le domaine du couplage de la réflectivité des rayons-X et la fluorescence des rayons-X en incidence rasante.
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La révolution en biologie structurale est en cours (01-2016)
« La révolution n'est pas cristallisée: une nouvelle méthode balaie la biologie structurale ». C'est ainsi que Nature commente fin 2015 les développements récents en Cryo-MET. Patrick Bron et Stefano Trapani ( Centre de Biochimie Structurale, Montpellier ) commentent ces développements en prenant comme exemple l'étude récente publiée dans Nature par une équipe Strasbourgeoise de l'Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire.
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La diffraction des électrons : c’est dynamique ! (09-2015)
Les évolutions dans le domaine de la diffraction des électrons sont très importantes ces dernières années ce qui a permis de résoudre beaucoup plus facilement qu'avant des structures cristallines par la technique de précession des électrons. Philippe Boullay, Damien Jacob et Pascal Roussel commentent ici un article récent ( Palatinus et al., Acta Cryst A71(2015), 235-244 ) qui décrit une autre avancée très importante, i.e. l'utilisation de la théorie dynamique de la diffraction des électrons pour les données obtenues par la précession des électrons en mode tomographique, qui permet d'affiner des structures jusqu'à une fiabilité pas trop loin de celle des affinements sur données rayons-X.
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Au-delà des cristaux apériodiques (7-2015)
Denis Gratias commente un article récemment paru dans Acta Crystallographica B (U. Grimm, Acta Cryst. (2015). B71, 258-274) qui touche les fondements de la cristallographie.