À la une

Les participants à l'école de réflectivité édition 2024 sont priés de télécharger les programmes ci-dessous et de tester leur fonctionnement sur leur ordinateur portable. En 2024 nous utilisons principalement REFLEX: il est par conséquent primordial de télécharger ce logiciel. Les participants très rapides peuvent tester également MOTOFIT.

REFLEX

REFLEX est un programme libre développé par Guillaume Vignaud et Alain Gibaud (Windows, Linux, Mac). Il est basé sur la run-time library de MATLAB. Cette librairie doit être installée en tant qu'administrateur. Téléchargements et instructions d'installation ici. La version la plus récente est REFLEX53. Le démarrage du programme peut être lent. Patientez et trois fenêtres distinctes s'ouvrent après avoir choisi 'X-ray reflectivity' sur la première fenêtre.

MOTOFIT

Motofit (Windows) est un programme libre pour fitter des données de réflectivité spéculaires développé par Andrew Nelson. La specificité de Motofit est qu'il intègre un module pour l'ajustement par algorithme génétique. Un wiki est disponible à cette adresse ou ici. Comme IMD5, Motofit  est utilisé en tant qu'extension d'un autre programme, cette fois-ci IGOR-PRO. On n'a pas besoin d'avoir la licence payante d'IGOR-PRO, mais on peut rester en fonctionnalité démo sans perdre toutes les fonctionnalités de Motofit. 

Étape 1: téléchargement de la version démo d'IGOR-PRO8 ici.  L'installer.

Étape 2: téléchargement des installateurs de Motofit pour IGOR-PRO8 ici. Lire les instructions dans le fichier INSTALL et suivre les 5 étapes y décrites. 

Le programme peut être démarré en lançant Igor64.exe se trouvant dans le répertoire ...\wavemetrics\Igor Pro 8 Folder\IgorBinaries_x64. Le menu Motofit se trouve à l'avant-dernière position dans la barre des menus, juste avant 'Help'. Load Motofit package et vérifie le menu de nouveau: vous devriez avoir une dizaine d'items de menu pour Motofit.

REFNX

Un nouveau programme est REFNX, basé sur Python. Il peut être trouvé ici. 

REFLECTOOLS & REFCONVERT (updated 07-10-2024)

REFLECTOOLS (Windows) est un programme GUI pour convertir des valeurs de densité massique aux valeurs de densité de longuer de diffusion et  vice-versa sous la condition que la composition chimique soit connue ou supposée. La conversion peut être faite pour un large domaine d'énergies de rayons-X. Téléchargez  REFLECTOOLS ici. Renommez le fichier reflectools2023.zpp à reflectools2023.zip et extrayez les fichiers dans un répertoire à votre choix. L'exécutable est reflectools2023.exe (correction bug dans le calcul de  l'énergie/longueur d'onde (07-10-2024))  . Si au démarrage le programme vous dit qu'un fichier manque, téléchargez celui-ci ici et placez-le dans le répertoire de reflectools2023.exe. L'executable se trouve dans le répertoire 'build\exe.win-amd64-3.7'. 

REFCONVERT (Windows) est un programme GUI pour convertir de fichiers de formats différents dans d'autres formats. Téléchargez REFCONVERT ici. Renommez le fichier RefConvert.xx à Refconvert.exe et mettez-le dans un répertoire à votre choix.

NOUVEAU (03-10-2024). REFCONVERT2024 (Windows) est la version la plus récente de REFCONVERT. Téléchargez REFCONVERT2024 ici. Renommez le fichier à refconvert2024.zpp à refconvert2024.zip et extrayez les fichiers dans un répertoire à votre choix. L'exécutable est refconvert2024.exe. Si au démarrage le programme vous dit qu'un fichier manque, téléchargez celui-ci ici et placez-le dans le répertoire de refconvert2024.exe. L'executable se trouve dans le répertoire 'build\exe.win-amd64-3.7'. 

ATTENTION: Pour ces trois programmes, faites un CLIC DROIT sur le lien vers ces fichiers, sélectionnez 'sauvegarder sous' (ou 'enregistrer le lien sous') et choissisez le répertoire où vous voulez installer les programmes. En même temps vous pouvez changer l'extension en '.zip' ou '.exe'.

Autres programmes

Les instructions d'installation  pour deux autres programmes pour l'analyse des données de réflectométrie (IMD et STOCHFIT) peuvent être trouvées ici. Ces programmes ne vont pas être utilisés pendant l'édition 2024 de l'école. 

Jeux de données pour TD

Téléchargez le répertoire zippé  ici (faites un CLIC DROIT). Renommez le fichier .zpp  à .zip, et dézippez dans un répertoire à votre choix.

Documents utils 

• Programme final pour l'école thématique (updated 30-9-2024) 
• Présentation A. van der Lee : Introduction à la réflectométrie (english version here - updated 07-10-2024)
• Présentation A. van der Lee : Terminologie et méthodes de fit en réflectométrie de rayons-X (english version here - updated 03-10-2024)
• Présentation S. Tardif : Grazing Incidence X-Ray Diffraction: A short introduction - updated 07-10-2024
• Présentation G. Vignaud : Formalisme matriciel et le programme Reflex
• Présentation D. Rébiscoul: Introduction to the study of surface by Small Angle X-ray Scattering
• Présentation S. Dourdain : Diffusion des rayons X et des neutrons
• Présentation S. Dourdain : Couplage de la réflectivité avec d’autres techniques d’analyse pour l’étude des couches minces et des surfaces
• Review paper sur la réflectométrie d'A. van der Lee
• Document pour les TD (A. van der Lee) : Getting started with MOTOFIT, LEPTOS, STOCHFIT, IMD, and REFLEX. Les TD sont principalement basés sur REFLEX.

• Qu'est-ce que la cristallographie ?
  • Histoire
  • Les ondes diffractées
  • Les cristaux et les autres
  • Les expériences
  • Les applications
  • Un peu de pédagogie
  • Des cristaux. L'art de définir en science - Le lexique de la cristallographie (version imprimable en format livret)

Les participants à l'école de réflectométrie édition 2021 sont priés de télécharger les programmes ci-dessous et de tester leur fonctionnement sur leur ordinateur portable. En 2021 nous utilisons principalement REFLEX: il est par conséquent primordial de télécharger ce logiciel. Les participants très rapides peuvent tester également MOTOFIT.

REFLEX

REFLEX est un programme libre développé par Guillaume Vignaud et Alain Gibaud (Windows, Linux, Mac). Il est basé sur la run-time library de MATLAB. Cette librairie doit être installée en tant qu'administrateur. Téléchargements et instructions d'installation ici. Le démarrage du programme peut être lent. Patientez et vous trouvez trois fenêtres distinctes après avoir choisi 'X-ray reflectivity' sur la première fenêtre.

MOTOFIT

Motofit (Windows) est un programme libre pour fitter des données de réflectivité spéculaires développé par Andrew Nelson. La specificité de Motofit est qu'il intègre un module pour l'ajustement par algorithme génétique. Un wiki est disponible à cette adresse. Comme IMD5, Motofit  est utilisé en tant qu'extension d'un autre programme, cette fois-ci IGOR-PRO. On n'a pas besoin d'avoir la licence payante d'IGOR-PRO, mais on peut rester en fonctionnalité démo sans perdre toutes les fonctionnalités de Motofit. 

Étape 1: téléchargement de la version démo d'IGOR-PRO8 ici.  L'installer.

Étape 2: téléchargement des installateurs de Motofit pour IGOR-PRO8 ici. Lire les instructions dans le fichier INSTALL et suivre les 5 étapes y décrites. 

Le programme peut être démarré en lançant Igor64.exe se trouvant dans le répertoire ...\wavemetrics\Igor Pro 8 Folder\IgorBinaries_x64. Le menu Motofit se trouve à l'avant-dernière position dans la barre des menus, juste avant 'Help'. Load Motofit package et vérifie le menu de nouveau: vous devriez avoir une dizaine d'items de menu pour Motofit.

REFLECTOOLS & REFCONVERT

REFLECTOOLS (Windows) est un programme GUI pour convertir des valeurs de densité massique aux valeurs de densité de longuer de diffusion et  vice-versa sous la condition que la composition chimique soit connue ou supposée. La conversion peut être faite pour un large domaine d'énergies de rayons-X. Téléchargez  REFLECTOOLS ici. Renommez le fichier reflectools.zpp à reflectools.zip et extrayez les fichiers dans un répertoire à votre choix. L'exécutable est reflectools2021.exe. Si au démarrage le programme vous dit qu'un fichier manque, téléchargez celui-ci ici et placez-le dans le répertoire de reflectools.exe. 

REFCONVERT (Windows) est un programme GUI pour convertir de fichiers de formats différents dans d'autres formats. Téléchargez REFCONVERT ici. Renommez le fichier RefConvert.xx to Refconvert.exe and mettez-le dans un répertoire à votre choix.

Pour ces deux programmes, faites un clic droit sur le lien vers ces fichiers, sélectionnez 'sauvegarder sous' et choissisez le répertoire où vous voulez installer les programmes. En même temps vous pouvez changer l'extension en '.zip' ou '.exe'.

Autres programmes

Les instructions d'installation  pour deux autres programmes pour l'analyse des données de réflectométrie (IMD et STOCHFIT) peuvent être trouvées ici. Ces programmes ne vont pas être utilisés pendant l'édition 2021 de l'école. 

Jeux de données pour TD

Téléchargez le répertoire zippé  ici. Renommez le fichier .zpp  à .zip, et dézippez dans un répertoire à votre choix.

Documents utils (les liens vers les présentations vont être activées après l'école)

• Programme final pour l'école thématique
• Présentation A. van der Lee : Introduction à la réflectométrie
• Présentation A. van der Lee : Terminologie et méthodes de fit en réflectométrie de rayons-X
• Présentation S. Tardif : à venir 
• Présentation G. Vignaud : à venir
• Présentation D. Rébiscoul et S. Dourdain: La réflecto, ça sert à quoi ?
• Présentation D. Rébiscoul : Cas d'études I
• Présentation S. Dourdain : Cas d'études II
• Review paper sur la réflectométrie d'A. van der Lee
• Document pour les TD (A. van der Lee) : Getting started with MOTOFIT, LEPTOS, STOCHFIT, IMD, and REFLEX. Les TD sont principalement basés sur REFLEX.

Tous les programmes ci-dessous devraient fonctionner sous Windows 7, 8 and 10. Il n'y a pas de solution simple pour MacOS ou Linux REFLEX tourne sous Linux. En 2021 nous utilisons principalement REFLEX: il est par conséquent primordial de télécharger ce logiciel et de vérifier s'il fonctionne correctement. Cette page va être mise à jour au fur et à mesure. Elle doit être finalisée le 27 septembre prochain. 

IMD5

IMD5 est un programme libre pour fitter des données de réflectivité spéculaires et hors-spéculaires développé par David Windt. Le programme fonctionne à travers d'une licence payante du logiciel IDL ou bien en tant qu'extension du programme XOP développé à l'ESRF. On suit la procédure d'installation en tant qu'extension de XOP pour Windows XP et 7.

Étape 1: téléchargement de XOP2.3 ici. Prendre le fichier xop23_Windows_20140616.zip. Copier l'intégralité du fichier .zip  dans un endroit sans espaces (p.e. c:\tools). On a maintenant un répertoire c:\tools\xop2.3. Éviter d'utiliser le bureau de Windows pour copier les fichiers.

Étape 2: téléchargement de IMD5 ici. Télécharger la dernière version d'IMD, actuellement imd_5.03.tar.gz. Ce fichier peut être dézippé par la plupart des logiciels de compression/décompression comme winzip ou 7-zip. Copier l'intégralité du contenu du fichier dans …\xop2.3\extensions. Il doit y avoir maintenant un répertoire appelé …\xop2.3\extensions\imd.

Étape 3: configuration de XOP pour IMD. Copier le fichier ...\xop2.3\extensions\imd\extras\imd4xop.bat à: ...\xop2.3\imd4xop.bat. Ensuite copier le fichier ...\xop2.3\extensions\imd\extras\imd4xop.vbs à: ...\xop2.3\imd4xop.vbs. Finalement éditer (avec un éditeur de texte comme Notepad) le fichier ...\xop2.3\imd4xop.bat pour changer en cas de besoin la deuxième ligne: c:\xop2.3\xop.bat à sa valeur exacte - en fonction où est installé XOP2.3, donc p.e. c:\tools\xop2.3\xop.bat. Sauvegarder et quitter.

On peut créer un raccourci sur le bureau qui pointe vers soit le fichier ...\xop2.3\imd4xop.vbs ou le fichier ...\xop2.3\imd4xop.bat et double-cliquer sur ce raccourci pour démarrer IMD5.1.

Stochfit

Stochfit est un programme libre pour fitter des données de réflectivité spéculaires développé par Danauskus et al. Le programme s'installe facilement en téléchargeant le fichier d'installation ici. Double-cliquer sur le fichier téléchargé et suivre les instructions.

Motofit

Motofit est un programme libre pour fitter des données de réflectivité spéculaires développé par Andrew Nelson. Un wiki est disponible à cette adresse. Comme IMD5, Motofit  est utilisé en tant qu'extension d'un autre programme, cette fois-ci IGOR-PRO. On n'a pas besoin d'avoir la licence payante d'IGOR-PRO, mais on peut rester en fonctionnalité démo sans perdre toutes les fonctionnalités de Motofit. 

Étape 1: téléchargement de la version démo d'IGOR-PRO7 ici. ou celle d'IGOR-PRO8 ici.  L'installer.

Étape 2: téléchargement des installateurs de Motofit pour IGOR-PRO7 ou IGOR-PRO8 ici. Double-cliquer sur le fichier d'installation motofitInstaller.exe.

Le programme peut être démarré en lançant Igor.exe se trouvant dans le répertoire ...\wavemetrics\Igor Pro Folder\. Le menu Motofit se trouve tout à droite dans la barre des menus (dans la version IGOR-PRO6 au moins).

Reflex

Reflex est un programme libre développé par Guillaume Vignaud et Alain Gibaud. Il est basé sur la run-time library de MATLAB. Cette librairie doit être installée en tant qu'administrateur. Téléchargements et instructions d'installation ici. Le démarrage du programme peut être lent. Patientez et vous trouvez trois fenêtres distinctes après avoir choisi 'X-ray reflectivity' sur la première fenêtre.

Reflectools & Refconvert

Reflectools est un programme GUI pour convertir des valeurs de densité massique aux valeurs de densité de longuer de diffusion et  vice-versa sous la condition que la composition chimique soit connue ou supposée. La conversion peut être faite pour un large domaine d'énergies de rayons-X. Téléchargez  Reflectools ici. Renommez le fichier reflectools.zpp à reflectools.zip et extrayez les fichiers dans un répertoire à votre choix. L'exécutable est reflectools.exe.

Refconvert est un programme GUI pour convertir de fichiers de formats différents dans d'autres formats. Téléchargez Refconvert ici. Renommez le fichier RefConvert.xx to Refconvert.exe and mettez-le dans un répertoire à votre choix.

Jeux de données pour TD

Téléchargez le répertoire zippé  ici. Renommez le fichier .zpp  à .zip, et dézippez dans un répertoire à votre choix.

Documents utils (les liens vers les présentations vont être activées après l'école)

• Programme final pour l'école thématique
• Présentation A. van der Lee : Introduction à la réflectométrie
• Présentation A. van der Lee : Terminologie et méthodes de fit en réflectométrie de rayons-X
• Présentation S. Tardif : à venir 
• Présentation G. Vignaud : à venir
• Présentation D. Rébiscoul et S. Dourdain: La réflecto, ça sert à quoi ?
• Présentation D. Rébiscoul : Cas d'études I
• Présentation S. Dourdain : Cas d'études II
• Review paper sur la réflectométrie d'A. van der Lee
• Document pour les TD (A. van der Lee) : Getting started with MOTOFIT, LEPTOS, STOCHFIT, IMD, and REFLEX. Les TD sont principalement basés sur STOCHFIT et REFLEX.

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