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VESTA

Le logiciel VESTA est un puissant programme de visualisation et d'analyse de structures cristallines. Développé par le Japan Institute of Materials Science, VESTA est largement utilisé dans le domaine de la cristallographie et de la science des matériaux. Principales caractéristiques de VESTA :
  1. Visualisation 3D : VESTA permet de visualiser les structures cristallines en 3D avec une large gamme de modes de visualisation, y compris les bâtonnets, les sphères de Van der Walls et les polyèdres de coordination.
  2. Manipulation interactive : Le logiciel permet aux utilisateurs de manipuler les structures, de faire pivoter, zoomer et déplacer la visualisation pour examiner les détails à différentes échelles.
  3. Analyse des liaisons : VESTA propose des outils d'analyse des liaisons et des distances entre les atomes, permettant de comprendre les interactions chimiques et les motifs structuraux.
  4. Cartes électroniques et de densité : Il est possible de générer et de visualiser des cartes électroniques, des densités électroniques et d'autres propriétés physiques associées aux structures cristallines.
  5. Superposition de structures : VESTA permet de superposer et de comparer différentes structures cristallines, facilitant ainsi l'étude des variations et des similitudes entre les composés.
  6. Compatibilité de formats : Il peut lire et écrire plusieurs formats de fichiers, notamment CIF, POSCAR, XYZ, et plus encore.

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Pour apprendre à utiliser VESTA :

Mercury

Le logiciel Mercury est un puissant outil d'analyse et de visualisation des structures moléculaires cristallines.
Développé par le Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC), il est spécifiquement conçu pour interagir avec les données de la Cambridge Structural Database (CSD) et d'autres sources de données structurales.
Mercury offre une variété de fonctionnalités pour examiner et manipuler les structures tridimensionnelles de manière interactive. Parmi ses principales caractéristiques, on retrouve :
  • Visualisation : Mercury permet de visualiser les structures cristallines en utilisant divers modes de représentation, notamment les bâtonnets, les sphères de Van der Waals et les surfaces.
  • Analyse géométrique : Le logiciel facilite l'analyse des liaisons, des angles et des distances moléculaires pour comprendre la géométrie et les interactions au sein des molécules cristallines.
  • Recherche de motifs : Mercury offre des outils de recherche pour identifier des motifs structuraux spécifiques, tels que les liaisons hydrogène, les interactions π-π, etc.
  • Superposition : Il permet de superposer différentes structures pour comparer et analyser les différences et les similitudes entre elles.
  • Calcul des propriétés physico-chimiques : Le logiciel permet de calculer diverses propriétés moléculaires telles que les surfaces de contacts, les volumes des cavités, etc.

Mercury est largement utilisé dans la recherche en chimie, en pharmacologie et dans d'autres domaines scientifiques pour étudier les propriétés structurales et les interactions moléculaires.